LIMS计划实施阶段是指从正式订购所选定的LIMS系统开始，直到该系统能够在实验室中满意地运行，并且涵盖了必要的培训和文档化。LIMS计划实施是其生命周期中最形象、最激动人心、也是最让大家有成就感的一个阶段，LIMS团队必须清楚的一点是：这一阶段必须是建立在良好的前面工作的基础之上的，否则在这一阶段再努力也不能够获得整个LIMS工程的成功。
对于今天大多数的实验室而言，实施LIMS的关键是在于前期的方案设计、产品选型，因为毕竟愿意去进行完全自建LIMS系统冒险的实验室寥寥无几。这也是前面第六章、第七章采用较大篇幅详细叙述的原因。如果前期的方案设计、工程设计较为科学，并在对各LIMS厂商的RTF进行仔细的考察评价选定了合适的LIMS系统，那么接来后具体的硬件、软件安装等具体的LIMS计划实施工作实际上就较为顺利。通常，在这个阶段实验室只要配合LIMS厂商推进工程进行就可以了。