LIMS工程的实施对于实验室来说并不意味着终结，而是一个全新的开始。能否很好地利用LIMS来实现各项预期效益，全面提升实验室质量管理水平，关键之处在于LIMS实施后的管理与维护工作。在实践中，有相当一部分实验室的LIMS系统未能达到预期的目标，究其原因很重要的一点是由于实验室对于LIMS未能理解透彻。尽管ASTM E1578《LIMS标准指南》中给出了一个直观的LIMS概念模型，但是这个模型主要关注的是实验室环境中用户涉及的各项功能标识与可视化，而并没有从系统的策略定位上去考虑。为了克服这一问题，有学者提出了关注LIMS在实验室及所在企业/机构策略定位的LIMS矩阵，更多地涉及了LIMS实施后在整个企业/机构管理中的合理定位以及常见问题的克服。这个矩阵是将三种类型的LIMS—操作型、逻辑型以及策略型与实验室的规模以及由这个系统所能够承担的企业/机构的任务进行作图。这一方法可以有效地帮助实验室相关人员加深对LIMS尤其是其在管理中应该发挥什么作用以及如何发挥作用的理解。